为了对cellpose微调模型在测试数据集上的效果进行评估,在Grok的帮助下弄了一个小工具。
这个评估工具能够读取cellpose保存的npy文件,然后随机抽取指定数量的结构展示mask给专家遍历,然后由专家评估正确与否。专家遍历完成后自动计算正确率。专家的评估记录自动记录到csv表格文件中。而且这个工具还支持断点继续。具体使用效果如下:
完整代码如下:
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使用时需要注意的就是运行它的python环境。最好是使用cellpose(目前支持版本为4.0.1)的相同python环境运行该程序,避免对cellpose保存的npy文件读取错误。