Loading...
像threshold_otsu或者threshold_li等方法得到的阈值就是一个数值,然后得应用到全局...
通过阈值分割图像中的前景和背景是成像数据分析中基础的基础。此处以skimage.filters.thre...
点簇状信号在成像数据中非常常见。这里提供一个整合好的函数方便进行分析。
在多色成像时会遇到通道对齐的问题,一个比较可靠的做法是使用多色荧光小球作为marker。
此处以批量缩小ROI为例介绍如何利用shapely模块对ROI进行调整。
图像分割时很多模型给出的都是mask图像,为了方便转换为ROI,这里提供一段python代码基于mask...
在多通道成像的时候,由于各种原因可能存在需要配准的情况。这里介绍一种最简单的刚性配准方式。
关键是基于shapely模块中的within方法,判断信号点与ROI的包含关系。