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三维成像数据中的物体分割,不能简单的先逐层分析每个slice,再堆叠回去。因此这里再专门提供一个三维点簇...
通过阈值分割图像中的前景和背景是成像数据分析中基础的基础。此处以skimage.filters.thre...
点簇状信号在成像数据中非常常见。这里提供一个整合好的函数方便进行分析。
在多色成像时会遇到通道对齐的问题,一个比较可靠的做法是使用多色荧光小球作为marker。
此处以批量缩小ROI为例介绍如何利用shapely模块对ROI进行调整。
使用编程的方式能够高度自定义地对大量数据进行分析,但为保证分析的准确性,需要对中间步骤进行充分的可视化检查。
当要对大量数据进行分析之前,须先快速预览数据。了解一些基本情况是非常必要的。这里整理了下我常用的预览成像...
图像分割时很多模型给出的都是mask图像,为了方便转换为ROI,这里提供一段python代码基于mask...