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ImageJ 26 python 12 图像分割 7 cellpose 6 matplotlib 5 三维作图 4 细胞膜 4 roifile 4 seaborn 4 单分子 3 AI 3 grok 3 mask 3 pandas 3 plotly 3 SAM 3 背景阈值 2 仿射变换 2 高斯拟合 2 颗粒分析 2 通道对齐 2 图像配准 2 信噪比 2 直方分布 2 conda 2 HSB 2 imaris 2 joblib 2 k3d 2 KDTree 2
尝鲜cellpose-sam

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本文介绍下今年更新的cellpose sam的试用情况。

基于阈值与watershed的三维点簇状信号分割

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三维成像数据中的物体分割,不能简单的先逐层分析每个slice,再堆叠回去。因此这里再专门提供一个三维点簇状信号分割的函数。

分割一切显微图像的micro-SAM

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稍微得空,简单记录下之前看到的一个号称可以分割一切显微图像micro SAM工具。

使用cellpose批量分割图像

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这里介绍如何使用cellpose批量分割大量图像,并以此为例展示如何阅读和使用他人的代码。

将AI图像分割mask转换为roi

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本文介绍如何使用ImageJ将最常见的AI分割所得到的mask图像转换为ROI,方便后续分析。

使用cellpose快速分割细胞

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介绍使用 cellpose 快速分割图像中的细胞。

使用napari-sam4is快速分割图像中的物体

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介绍使用napari中的sam4is插件调用SAM快速分割图像中的物体。

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